海军大臣是风磨坊最不受欢迎的人。沃克一家盼望已久的探险之旅，因为爸爸突然被派往伦敦执行公务而泡汤了。然而，爸爸妈妈竟然同意燕子号船员搭乘小船巫师号前往秘密群岛探险，连船宝宝布里奇特也获准加入探险者的队伍，这让孩子们喜出望外！他们将在这片秘密水域绘制地形图，岛屿、河流等将随着他们的探险而一点点地出现在地图上。更让人意外的是，亚马孙号船员竟然也来到这片秘密水域，加入了探险队伍。
在以妖精岛为中心的秘密水域，他们发现了神秘的大脚印，遇到了鳗鱼部落的野人。更可怕的是，布里奇特被抓走了，即将成为野人的祭品……