本书详细研究十七、十八、十九三个世纪的中国学术史，阐释了学术发展的不同阶段及其相互转化的原因，从哲学和思想层面分析清代的学派、代表人物和典型作品，提出了诸多新见解，是公认的空前佳作。

一 反动与先驱

二 清代学术变迁与政治的影响（上）

三 清代学术变迁与政治的影响（中）

四 清代学术变迁与政治的影响（下）

近三百年学术史附表

五 阳明学派之余波及其修正——黄梨洲

  附：孙夏峰 李二曲 余姚王学家 李穆堂

六 清代经学之建设——顾亭林 阎百诗

  附：胡胐明 万充宗

七 两畸儒——王船山 朱舜水

八 清初史学之建设——万季野 全谢山

  附：初期史学家及地理学家

九 程朱学派及其依附者 ——张杨园 陆桴亭 陆稼书 王白田

  附：其他

十 实践实用主义——颜习斋 李恕谷

  附：王昆绳 程绵庄 恽皋闻 戴子高

十一 科学之曙光——王寅旭 梅定九 陈资斋

  附：其他

十二 清初学海波澜余录

十三 清代学者整理旧学之总成绩（一）

——经学 小学及音韵学

十四 清代学者整理旧学之总成绩（二）

——校注古籍 辨伪书 辑佚书

十五 清代学者整理旧学之总成绩（三）

——史学 方志学 地理学及谱牒学

十六 清代学者整理旧学之总成绩（四）

——历算学及其他科学 乐曲学