本书共包括四个部分。第一部分介绍了计算机软件在核酸序列分析中的应用,主要包括序列格式转换、结构功能分析、克隆与引物设计等;第二部分介绍了计算机软件在蛋白质序列分析中的应用,主要包括理化性质分析、结构预测、三维分子显示等;第三部分介绍了计算机软件在序列比对中的应用,包括BLAST、本地BLAST、多序列两两比对与进化树分析等;第四部分介绍了计算机软件在文献管理与引用中的应用,主要包括文献管理、参考文献的引用等。
本书主要面向生物、医学专业的研究生、高年级本科生,以及相关专业的其他研究人员。
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书名 | 分子生物学软件应用/现代生物医学科研技术丛书 |
分类 | 科学技术-自然科学-生物科学 |
作者 | 刘旭光//张杰 |
出版社 | 北京大学医学出版社 |
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介绍 |
编辑推荐 本书共包括四个部分。第一部分介绍了计算机软件在核酸序列分析中的应用,主要包括序列格式转换、结构功能分析、克隆与引物设计等;第二部分介绍了计算机软件在蛋白质序列分析中的应用,主要包括理化性质分析、结构预测、三维分子显示等;第三部分介绍了计算机软件在序列比对中的应用,包括BLAST、本地BLAST、多序列两两比对与进化树分析等;第四部分介绍了计算机软件在文献管理与引用中的应用,主要包括文献管理、参考文献的引用等。 本书主要面向生物、医学专业的研究生、高年级本科生,以及相关专业的其他研究人员。 目录 第一部分 核酸序列分析 1 序列检索与格式转换 1.1序列检索 1.2序列格式简介 1.3格式转换 2 一级结构分析 2.1组成成分分析 2.2重复序列 2.3序列变换 3 克隆 3.1酶切位点查找 3.2模拟电泳 3.3电泳图像分析 3.4质粒绘图 3.5克隆策略与过程显示 4 引物设计 4.1引物设计的基本原则 4.2引物设计与分析 4.3高通量引物与探针设计 5 测序拼装 5.1测序图分析 5.2测序拼装 6 DNA功能分析 6.1 ORF查找与翻译 6.2 Motif查找 7 RNA二级结构预测 7.1 RNAstructure 7.2 RNAdraw 7.3 DNAstar 第二部分 蛋白质序列分析 1 理化性质分析 1.1蛋白酶酶切特性 1.2滴定曲线与等电点 1.3亲水性和疏水性 1.4电荷密度 2 二级结构预测 2.1 DNAstar 2.2 Vector NTI Advance 2.3 ANTHEPR()T 3 其他特殊局部结构分析 3.1膜蛋白的跨膜螺旋 3.2信号肽 3.3卷曲螺旋 3.4抗原决定簇 4 三维分子显示 4.1 RasMol 4.2 Vector NTI Advance 4.3 Cn3D 第三部分 序列比对及进化树 1 BLAST 1.1 BLAST简介 1.2 BLAST、实践 1.3 BLAST、高级选项 2 本地BLAKI 3 多序列之间的两两比对与进化树分析 3.1 C1ustalX 3.2 DNAstar 3.3 Vector NTI Advance 3.4 PLYLIP 第四部分 文献管理与引用 1 文献管理 1.1 Reference Manager 1.2 EndINote 1.3 NoteExpress 1.4全文查找 2 在Word中引用文献 2.1 Reference Manager 2.2 EndNote 2.3 NoteExpress 附录1 软件简介 附录2 参考文献 |
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