《本草中国》第二季延续《本草中国》系列纪录片的特点，以“本草”为核心要素，讲述的是本草的功能和用法。相对于第一季对本草药采摘、炮制、配伍的环节和流程展示，第二季把“用药”作为故事的核心，通过本草把医生与患者的故事串联起来。在独特的中国传统文化视角下，用传统中医药哲学“天、地、人”的思想统领全片。除了在治病的环节体现“药”，本季增加本草的生命描写，吸收植物、动物纪录片的拍摄方式，在第一季从人的视角来拍摄的基础上，第二季从本草的生长和人的生长视角出发，丰富角度，由表及里，由浅入深，由形至神，由趣达思，充分引发观众对中医的兴趣。同时本片亦呈现了四十余位以悬壶济世为己任的国医大师（13位）与中医药名老专家，展现他们令人叹为观止的医技和关乎生命的感人故事，充分彰显“大医精诚”的力量，渗透属于中国人的生命观、价值观和自然观。本书为同名出版物，并在央视复播时同步出版

第一集
天赐
艾灸
祛湿佳品——茯苓
宣肺利咽桔梗说
国医大师路志正：酷泡姜
第二集
共生
一莲出九药
经方妙用——大青龙汤
清肺化痰止咳良药——瓜菱
“板凳腿”
第三集
虫行
创面愈合之良药——蟑螂
国医大师张学文妙用水蛭
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