本书中，否定基督是历史人物论述了圣经是传说各虚构的产物批判了宗教采取的虚构历史、欺编人民群众的伪善本质，从而有力地宣传了无神论思想。作者的锋芒所及不仅批驳了一般的有神论，而且揭露了日本统治阶级制造的天皇制神话和以天理教为代表的形形色色的宗教迷信。本书在作才被害后第八天出版，一个月内次重版，在当时的日本社会上发生过重大的影响。

自序

一 绪论——基督何许人也

 (一)耶稣基督何许人也

 (二)基督果真有其人吗

 (三)一般国民的重要问题

二 圣经可信乎？（上）

 (一)作为基督传记的四福音书

 (二)四福音书记事的矛盾

 (三)福音书忘掉了诞生和升天两件大事

三 圣经可信乎？（中）

 (一)圣经何时成天何人之手

 (二)二世纪末无一定的经典

 (三)百余种经典异本

 (四)正经与伪经

 (五)保罗书信亦伪作也

四 圣经可信乎？（下）

 (一)圣经的演化

 (二)经典历史的三个时期

 (三)尼西亚会议

 (四)强盗会议

 (五)基督教徒四大家的考证

 (六)新约书大部分都是伪作

五 圣经以外的证迹（上）

 (一)正史上的所见的基督

 (二)第一世纪文学家的记事

 (三)哲人斐洛

 (四)大历史家塔西佗

 (五)尼禄皇帝迫害的事实

 (六)苏艾托尼乌斯

 (七)小普林尼

六 圣经以外的证迹（下）

 (一)犹太史家瑟弗斯

 (二)赛尔苏

 (三)基督诞生主死亡的年月

 (四)关于诞生时日的一百三十二种异说

 (五)历史所载的许许多多弥赛亚

 (六)古代遗物的探查

七 基督的起源（上）

 (一)宗教不一定要由个人创立

 (二)太阳崇拜与生殖器崇拜

 (三)生殖器的标志

 (四)太阳的记号

 (五)十字形也是生殖器的记号

 (六)古代各种十字形

 (七)十字架上的人像

 (八)三位一体的思想

八 基督的起源（中）

 (一)女神的信仰

 (二)女性的记号

 (三)两性兼有的神

 (四)基督的神性

 (五)柏拉图的教义与基督教

 (六)斐洛的教义与基督教

 (七)灵魂不灭之悦

 (八)一神的思想

 (九)中介者

十 基督的起源（下）

 (一)基督教道德的缺点

 (二)崇高善美的道德并非基督教所创始

 (三)基督教的兴起和奇迹的效力

 (四)初期基督教徒道德的卑污

 (五)圣餐会的小儿牺牲与淫荡

 (六)禁欲与道德

 (七)基督教徒的财产公有

 (八)天理教兴起的原因

 (九)天理教与初期基督教的类似

十一 基督的实体

 (一)没有基督存在的证据

 (二)基督教学者也认为基督是伪造的

 (三)古代各种神话和基督传记相符合

 (四)复活和处女神话的起源

 (五)圣诞节是异教冬至的节日

 (六)耶稣基督的词义

 (七)玛丽亚米迦勒和十二使徒的诞生日

 (八)十二使徒的事的迹

 (九)基督实体的结论

十二 结论抹杀之可也

 (一)基督教徒还相信什么

 (二)作为神话的价值

 (三)基督的宗教和生命

 (四)基督教徒的虚为

 (五)抹杀之可也跋

跋（高岛米峰）

 补白：幸德秋水的著作与参考文献

附录：

 序（雪岭迂人）

 《基督抹杀论》后记（堺利彦）

 回忆最后的离别（田冈岭云）

 幸德秋水和我（高岛米峰）

 狱中致三律师的申辩书（幸德传次郎）

 幸德秋水与基督抹杀事件始末（马采）

汉日西译名对照表