作者1980年代的《禅宗与中国文化》以及世纪之交的《中国思想史》都曾影响学林。本书收录的“都是与书有关的文章”，因此取名为“穿行书林断简”。作者葛兆光从与书册“彼此纠缠或者相依为命”的经历中总结出阅读的三种境界或称方法，即“旅游、围猎和侦探”。而作者的阅读无疑是侦探式的，文章由一部书展开，或探讨相关研究领域的现状与不足，或阐发自己对史学观念与方法的认识，乃至包含作者个人经历与志趣的感慨和对时代变迁与社会生活的关注。

卷首弁言

楔子·穿行书林断简

第Ⅰ辑

 历史的意味——读两种历史教科书和入门书的随想

 域外中国学资源的中断与接续——读马伯乐论著中译本

 见微与知著——评《日本学者研究中国史论著选译》(第七卷)

 彼此环绕和交错的历史——评夫马进主编《中国东アジア外交交流史の研究》

 我们能够拥有多少知识？——读《中国学术名著提要》

 重绘近代思想、社会与学术地图——评罗志田《权势转移：近代中国的思想、社会与学术》

第Ⅱ辑

 重读潘光旦先生——写在《潘光旦文集》出版之际

 不是旅行季节的旅行——读罗常培《苍洱之间·蜀道难》

 学问的意义毕竟久远——读《周一良集》

 古今知识世界的分类及其冲突——读朱越利编《道藏分类解题》

 宋代民间信仰的历史学研究思路——读皮庆生《宋代民间神祠研究》

 用图像呈现文明史——读《图说中国的文明》

 当时髦入了词典一读陆谷孙主编《英汉大辞典补编》

 在道教与文学之间——读《想象力的世界——二十世纪道教与中国古代文学论丛》

 非典围城中读疾病史论著

第Ⅲ辑

 重提古典文献的意义——《古诗文要籍叙录》修订版前言

 我注唐诗——《唐诗选注》新版序

 来自“中国”的思想史——《中国思想史》韩文本序

 什么够资格称“中国经典”？——《中国经典十种》修订版序

代后记·关于书评的写作