高等教育科技资源合理配置，是高等教育的教学、科研和社会服务产出能力提高的保障，是区域科技可持续发展能力和区域经济发展核心竞争力提升的根基。近年来，随着内蒙古自治区社会经济快速发展，高等教育发展与社会经济发展不平衡问题日益凸显，高等教育发展严重滞后于社会经济发展，成为社会经济高质量发展的“短板”。鉴于此，以近10年来内蒙古自治区高等科技资源配置发展现状为研究基础，以全国高等教育科技资源配置效率为标杆，测度内蒙古自治区高等教育科技资源配置效率，对比分析内蒙古高等教育科技资源配置存在的不足，借鉴国内外高等教育科技资源配置先进经验，提出优化内蒙古自治区高等教育科技资源配置的对策与建议，助力内蒙古自治区高等教育科学发展。