章 利用MacSyFinder鉴定细菌基因组中的蛋白分泌系统
1前言
2材料
2.1序列数据
2.2TXSScan中提供的预定义模型
2.3软件
3方法
3.1系统可用信息的汇编
3.2模型建立
3.3运行MacSyFinder
3.4输出文件,并用MacSyView显示结果
3.5优化与验证
4注释
参考文献
第2章 蛋白质分选预测
1前言
2三种预测方法
3预测算法
4预测方法的性能
……
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书名 | 细菌蛋白分泌系统研究方法与操作规程 |
分类 | 科学技术-工业科技-航空航天 |
作者 | (法)劳雷·詹来特,(法)埃里克·卡斯卡莱斯编 |
出版社 | 中国农业科学技术出版社 |
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介绍 |
目录 章 利用MacSyFinder鉴定细菌基因组中的蛋白分泌系统 1前言 2材料 2.1序列数据 2.2TXSScan中提供的预定义模型 2.3软件 3方法 3.1系统可用信息的汇编 3.2模型建立 3.3运行MacSyFinder 3.4输出文件,并用MacSyView显示结果 3.5优化与验证 4注释 参考文献 第2章 蛋白质分选预测 1前言 2三种预测方法 3预测算法 4预测方法的性能 …… 内容推荐 本书对细菌蛋白分泌系统的研究技术现状进行了总结,主要介绍细菌分泌系统研究技术概述,识别和定位分泌蛋白不同的亚单位,定义亚单位内的相互作用,大型复合物重构、纯化,通过定义组装路径装配或调节分泌过程,鉴别分泌效应器以及使用报告器跟踪效应器运输等。 |
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